Il nuovo studio sulla schizofrenia si concentra sulle interazioni proteina-proteina

Come per le persone, si può imparare molto su un gene osservando l'azienda che conserva e osservando come si comporta. Nel tentativo di scoprire più indizi sullo sviluppo della schizofrenia, i ricercatori della School of Medicine dell'Università di Pittsburgh hanno esplorato come le proteine ​​prodotte dai geni correlati alla schizofrenia interagissero tra loro.

"Possiamo dedurre cosa potrebbe fare la proteina controllando l'azienda che conserva", ha detto il ricercatore senior Madhavi Ganapathiraju, Ph.D., assistente professore di informatica biomedica, Pitt School of Medicine.

“Ad esempio, se so che hai molti amici che giocano a hockey, potrebbe significare che anche tu sei coinvolto nell'hockey. Allo stesso modo, se vediamo che una proteina sconosciuta interagisce con più proteine ​​coinvolte nella segnalazione neurale, ad esempio, c'è un'alta probabilità che anche l'entità sconosciuta sia coinvolta nella stessa ".

Nella storia recente, gli scienziati hanno condotto molti studi di associazione sull'intero genoma (GWAS) che hanno identificato con successo varianti geniche legate a un aumentato rischio di schizofrenia. Tuttavia, si sa relativamente poco sulle proteine ​​prodotte da questi geni, su cosa fanno e su come interagiscono, affermano i ricercatori.

"Gli studi GWAS e altri sforzi di ricerca ci hanno mostrato quali geni potrebbero essere rilevanti nella schizofrenia", ha detto Ganapathiraju. “Quello che abbiamo fatto è il passo successivo. Stiamo cercando di capire come questi geni si relazionano tra loro, il che potrebbe mostrarci i percorsi biologici che sono importanti nella malattia ".

In poche parole, ogni gene produce proteine ​​e queste proteine ​​tipicamente interagiscono tra loro in un processo biologico. Studiare come queste proteine ​​si comportano tra loro può far luce sul ruolo di un gene che non è stato ancora studiato, rivelando percorsi e processi biologici associati alla schizofrenia nonché la sua relazione con altre malattie complesse.

Dopo aver sviluppato e utilizzato un nuovo modello computazionale, chiamato HiPPIP (High-Precision Protein Interaction Prediction), i ricercatori hanno scoperto più di 500 nuove interazioni proteina-proteina (PPI) associate a geni legati alla schizofrenia.

I ricercatori aggiungono che mentre i geni legati alla schizofrenia identificati storicamente e attraverso GWAS avevano poca sovrapposizione, il modello ha mostrato che condividevano più di 100 interattori comuni. I risultati potrebbero portare a una maggiore comprensione delle basi biologiche di questa malattia mentale, nonché indicare la strada per i trattamenti.

I risultati sono pubblicati online in npj Schizofrenia, una rivista del Nature Publishing Group.

Fonte: Università di Pittsburgh Schools of the Health Sciences

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